본문 바로가기

Synthesis2

[정보] RNA의 화학적 합성 개요 RNA의 화학적 합성에 관하여 정리한 포스팅 내용 RNA 화학적 합성은 ribose의 2' hydroxyl에 추가적인 보호기가 필요하다는 점을 제외하면 DNA의 합성방법과 동일합니다. 이 위치는 일반적으로 합성 내내 안정적인 tert-butyldimethyl silyl기로 보호됩니다. 이들은 테트라부틸암모늄 플루오라이드(TBAF, tetrabutylammonium fluoride)와 같은 염기성 플루오라이드 이온을 첨가하여 최종 탈보호(deprotection) 단계에서 제거됩니다. 한편, 당과 염기의 나머지 위치는 DNA와 같은 방식으로 보호됩니다. 또한 다양한 실험환경(결합 시간, 단량체 전달 속도, 세척 단계 빈도 및 캡핑 시약 유형 등) 및 DNA 합성 프로토콜의 여러 매개변수를 조정하여 최대.. 2023. 6. 2.
[정보] Oligonucleotide 합성 원리 개요 올리고뉴클레오타이드(oligonucleotide)(이하 '올리고')를 화학적으로 합성하는 원리에 대해 설명한 포스팅 이번 포스팅에서는 PCR, DNA sequencing, Single Nucleotide Polymorphism (SNP) 등 분자생물학 실험에서 자주 써먹는 올리고가 어떤 화학적 원리로 합성되는지 확인해보겠습니다. 대부분의 올리고는 phosphoramidite를 재료로 하여 자동화된 합성기에서 합성됩니다. 포스포아미다이트(phosphoramidite)를 이용한 올리고의 화학적 합성은 무려 30년 전에 소개된 방법입니다. 이 방법은 DNA phosphoramidite nucleoside를 기반으로 하여 만들어진 방법입니다. 재료 여기서 DNA phosphoramidite nucleosi.. 2023. 6. 2.